孔令辉6岁开始打球，1986年进入省队，1988年进国青队，1991年入选国家队。历年来在国际乒联公布的世界男单排名前列，是世界杯、世锦赛和奥运会的大满贯冠军得主。

　　孔令辉是中国乒乓球界的一座里程碑。他拿到了中国历史上第一个横板进攻打法的男单冠军，和刘国梁一起开启中国男子乒坛“双子星时代”，总共夺得过11个世界冠军。

　　在1995年第43届世乒赛上，年仅20岁的孔令辉夺得男单冠军，登上了运动生涯的第一个巅峰。此后5年，孔令辉与刘国梁并肩挑起了中国队的大梁，两人不仅在团体赛上频频立功，在单打角逐中各守半区，并且在双打项目中默契配合，成为当今世界乒坛最有战斗力的一对搭档。在2000年悉尼奥运会上，孔令辉一路过关斩将，在决赛中战胜老对手瓦尔德内尔，夺得男子单打金牌，并与刘国梁合作夺得男双银牌，再次登上事业的最高峰。

　　与善于激情表演的刘国梁相比，孔令辉技术更加全面，临场发挥也相对稳定一些。悉尼奥运会夺得男单金牌后，孔令辉的打法更加呈现出一种“王者之气”。在当今的中国乒乓球国家队里，虽然王励勤、马琳、刘国正等新锐上升的势头咄咄逼人，但孔令辉丰富的大赛经验无疑是他与对手交锋取胜的重要筹码。

　　2006年10月12日孔令辉正式宣布退役。

　　随着运动员到教练员的角色转型，这位昔日的乒坛悍将正逐步向儒帅转变。