南薰门始建年代不详，相传为明朝朱棣在灵州时所建，同北京天安门几乎同一时间建造，因当时有传闻朱棣意图谋反，故朱棣将此门建的比天安门小一些。清乾隆三年（1739年）发生大地 震，府城尽毁，城门亦坍塌。乾隆五年又重建，有“南楼秋色”一景。清宣统三年（1911年），南薰门毁于战火。民国初年再次修复。