13年后，文成帝去世，年仅12岁的献文帝拓跋弘即位，24岁的冯氏成了皇太后。此时北魏“主幼国疑”，权臣乙浑密谋政变，冯太后当机立断，定策捕杀乙浑，随即宣布临朝称制，掌控大权，表现出了非凡的胆识和过人的政治才干，迅速稳定了北魏的政局，赢得了朝野一片喝彩。

    一年半后，冯太后归政献文帝，但不久就与献文帝产生剧烈的矛盾。拓跋鲜卑没有男女大防之类的贞洁观念，冯太后正值妙龄，耐不住守寡的孤寂冷清，与不少英俊男人传出绯闻。

    献文帝对此很介意，借故杀了冯太后最中意的情人李弈。太后非常不高兴，寻找借口，逼迫献文帝传位给不满五岁的太子拓跋宏，即后来著名的孝文帝。献文帝成了太上皇，这一年，他刚刚18岁，大概是历史上最年轻的太上皇。冯太后则成了太皇太后，再次出山，临朝听政，将北魏大权一手独揽，“杀戮赏罚，决之俄顷。是以威福兼作，震动内外”。

    冯太后有着高超的政治智慧和钢铁般的手腕，她“性严明，对阉官虽假以恩信，待以亲宠，决不放纵自流。左右之人虽有纤介之愆，便遭棰楚杖责，多者至百余，少亦数十”。不过，她还有另一面：“生性宽豁仁裕，不计前嫌，事后仍待之如初，有的因此更加富贵。正因如此，人人怀于利欲，至死而不思退。”