巩义宋陵在历史上曾多次遭到破坏，特别是在宋金战乱时期，不但地面建筑焚毁殆尽，地宫也多被盗掘，甚至宋太祖赵匡胤的永昌陵也未能幸免。
　　据载，当时有一伙盗墓贼挖开了宋太祖永昌陵的地宫，把里面的珍宝洗掠一空。其中一个姓朱的大盗贼，想把赵匡胤身上的玉带取下来，但尸体沉重，无法搬动。他用绳子一头套住尸体脖子，一头系住自己的肩膀，骑坐在尸体上，想把尸体拉起来。没料到赵匡胤的尸体坐起来后，和他面对面，突然从尸体口中喷出一股黑水，正喷在盗贼脸上。从此盗贼脸上留下一大片黑记，无论如何都洗不掉，人称“朱漆脸”。后来这伙盗墓贼被官府抓获，朱漆脸落了个杀头的下场。
　　所有帝陵中，最惨不忍睹的是宋哲宗的永泰陵，不但陵墓尽遭盗掘，宋哲宗的尸体也被拉出地宫，抛弃在荒草野地之中。太常少卿方庭硕出使金国，路过帝陵，看到哲宗的尸体暴露在外，不禁大哭，脱下自己的袍服，把宋哲宗的尸体包裹以后，重新埋进地宫。
　　对宋陵进行毁灭性破坏的是当时的伪齐皇帝刘豫。刘豫原是北宋大臣，投降金国后被封为大齐皇帝。一次刘豫在市场上看到有个士兵在卖玉碗，抓住一问，才知道是从宋陵盗来的。刘豫马上任命他儿子刘麟为河南淘沙官，把宋陵盗掘一空，连民间坟墓也不放过。史载“刘豫僭立，见兵士卖陵中玉碗，即置淘沙官，再发河南山陵及发民间无主坟墓”。刘豫大规模盗掘宋陵以后，为了掩盖证据，又纵火焚烧地面建筑，大火数月不灭。
　　南宋高宗时，曾派兵部侍郎张焘祭扫宋陵，返京后，高宗询问帝陵的情况，张焘无言以对，只是说：“万世不可忘此贼。”高宗叹息道：“山陵事从俭约，金玉之物，断不可以一豪置其中，前世葬之害，可以为鉴。”