清凉阁共有三层，其建筑风格独特，构思奇巧，雕梁画栋、五脊六兽、斗拱重檐。东门悬有风动石匾，西门高挂扇形镏金匾，南侧嵌有圆雕龙头、扇形匾上书“清凉阁”三个镏金大字；风动石匾制作古怪，双童簇拥梅花鹿、大风不动小风动。

　　清凉阁上下三层，结构各异，引人入胜，第一层为搭券四门式；第二层是实芯四室式；第三层乃明柱回廊式，该建筑顶层系“木砖补葺”，四面明柱、单门殿堂，白墙壁画，琉璃瓦顶，清新明快，古朴高雅。下面两层是全石建筑，错落有致，欲争有让，高低优仰，犬牙交错，跌宕起伏，勾心斗角，颇有力学价值。

　　更为奇特的是，如此高大的建筑物，竟然不打跟基，不填辅料，以天然石底为基础，块块巨石就地而起，从下到上完全干打垒而成。石块巨大惊人，有的长过数米，有的重达数吨，有的原封不动，有的錾迹寥寥寥，构造粗扩奔放，设计独出心裁。整个建筑充满古朴粗糙之美，正如当地民谣所说的“一块石头一匹梁、一块石头一堵墙”。清凉阁巍巍然，凛凛然，耸立于山间村首，蔚为壮观。

　　清凉阁上面两层皆为庙宇，最上层是玉皇庙顶，供玉皇大帝，第二层分四室；东室三皇庙，供尧舜禹；南室三义堂，供刘关张；北室阎王殿，供阎罗王；西室观音祠，供送子观音、癍疹娘娘和眼光娘娘。下层是搭券形建筑，朝东向西宛如城门，是于家村的东大门。拱券中央预部有于喜春侄儿于朝兴雕刻的碑文：“万历九年起根源，一人修筑其实难。二十五年完下节，思量何日得周全。阖村都说使木植，凭吾独力凿石山。经营暂停观此境，等待功成万古传。”