东汉时期，五朵山已经有早期道教人士活动，唐代道教人士在海拔1665米的主峰圣朵上修建起奇立山龙堂，为祈雨圣地，著名道士吴筠在此创建吴筠观，五朵山道观初具规模。 

    民间传说，明朝初年在宫廷争斗中失败的建文皇帝隐姓埋名，在道教高人张三丰保护下，隐居在五朵山出家修行，得道后被尊为真武大帝，民间称其为真武祖师。五朵山由此成为真武祖师道场，与“南顶”武当山并称为“北顶”，一跃而为著名的道教圣地。明清时期的“朝北顶”也成为中原和江汉地区道教信众的一项盛事。
    1978年，五朵山道观被批准为河南省14座重点开放道观之一，古老的千年道观又重新焕发出青春。2002年，时任全国道教协会会长闵智亭亲笔题名“北顶五朵山”，并慨然出任五朵山道观名誉道长。2007年，闵会长仙升后遗世的灵骨落座于五朵山闵公祠，更为五朵山凭添无穷仙气。